رسیدگی به جرائم مربوط به وظایف خاص با محاکم نظامی است و رسیدگی به جرائم عمومی یا جرائم در مقام ضابط دادگستری با محاکم عمومی است.
به استناد ماده ۲۸ ق.آ.د.ک ضابطان مامورانی هستند که تحت نظارت و تعلیمات دادستان در کشف جرم، حفظ آثار و علائم و جمع آوری ادله وقوع جرم، شناسایی، یافتن و جلوگیری از فرار و مخفی شدن متهم، تحقیقات مقدماتی، ابلاغ اوراق و اجرای تصمیمات قضایی به موجب قانون اقدام می کنند.
به استناد تبصره ۲ ماده ۵۹۷ ق.آ.د.ک منظور از جرائم مربوط به وظایف خاص نظامی و انتظامی، جرائمی است که اعضای نیروهای مسلح در ارتباط با وظایف و مسئولیت های نظامی و انتظامی که طبق قانون و مقررات به عهده آنان است مرتکب گردند.